丸の内のインテリジェントビル、代々木公園、新宿の地下通路…。
　「扉」の向こうには延々と闇の世界が広がり、入った者は誰一人帰ってこなかった。

　女性科学者加賀見玲子の著書から、「扉」が異星人の築いた"eclipse"と呼ばれる古代文明の遺跡に繋がっていると確信した政府の「扉」調査機構代表・九条龍介は、民間に対して一切の情報をシャットアウトするが、それでもネット上には噂から真実まで様々な情報が錯綜する。

　九条は玲子に「扉」の調査を依頼し、"eclipse"よりの生還者を保護したことを伝える。
　それは彼女の腹違いの兄・那岐悠二であり、彼は既に廃人と化していた。

　一方、財界の重鎮相庭グループ総裁相庭喜重郎の一人娘葉子は冒険家集団"ベンチャーズ"のハルパ・リマ・ニックを雇い、"eclipse"の彼方に眠るといわれる「大いなる力」を手に入れようとする。

　13の「扉」を巡る冒険の中で、ハルパ達は"eclipse"に連れ去られた恋人の救出に動く男ローランド＝ライツェンガーと協力し、九条一派と対峙することになる。

　そして、物語は後半、遂に闇の世界"eclipse"へと舞台を移す。
　インターネットサイト「eclipse network」を開き、情報を操る謎のWebmaster。
　"eclipse"の彼方より流れてくる歌声。
　目に見えない仕掛けにかかり、命を落としていく挑戦者達。
　
　誰が"eclipse"の彼方まで辿り着き、そこで一体何を見るのか…？